Контейнеризированный, масштабируемый рабочий процесс RNA-Seq в Nextflow: QC (FastQC/MultiQC), выравнивание (STAR/HISAT2), квантование (Salmon/featureCounts), анализ дифференциальной экспрессии (DESeq2), поддержка Docker/Singularity, CI/CD GitHub Actions.