Мелкая программа на Java, работающая с онтологией. Доработка

Имеется программа:

https://github.com/fekaputra/course-tutorial

Она уже умеет делать часть требуемых задач и имеет базу, имеются примеры некоторых пунктов. Ее требуется доработать и сделать направленную на решение следующих задач:

Коротко: Просит указать где фаил и предоставляет возможности экспортировать фаил в другом формате.  Имеет опцию добавить новую запись. Дает вариант выбора запросов (запросы находяться тут \course-tutorial-master\input\query)

б. Параметры для пользователя, чтобы выбрать и активировать причины, предоставляемые выбранными API 

В самой программе уже имеются все онтологии и фаилы.