Контейнеризований, масштабований робочий процес RNA-Seq у Nextflow: QC (FastQC/MultiQC), вирівнювання (STAR/HISAT2), кількісна оцінка (Salmon/featureCounts), аналіз диференційної експресії (DESeq2), підтримка Docker/Singularity, CI/CD GitHub Actions.