Konrad Gorzelańczyk
Prywatna wiadomość
Zaproponuj zlecenie
Poznan,
Polska
gotowy do podjęcia pracy
Ranking
Poziom znajomości języków obcych
Polski: native
English: zaawansowany
CV
Jestem studentem 4. semestru Inżynierii Bioinformatycznej na Politechnice Poznańskiej. Prowadzę odtwarzalne badania dynamiki molekularnej (MD) w GROMACS (TIP4P, NVT/NPT) na klastrach HPC i prezentowałem wyniki prof. J. Błażewiczowi. Piszę produkcyjny kod w C++17 (ponad 3 lata, algorytm genetyczny do składania DNA z adaptacyjnym krzyżowaniem/mutacją, Google Test, CMake) i Pythonie (NumPy, SciPy, pandas, MDAnalysis) oraz R/Bioconductor (analizy różnicowej ekspresji, 3D-QSAR). Automatyzuję workflowy od PackMol po analizy trajektorii (RDF, MSD, powierzchnie energii), pracując na Linuxie, Slurmie i GPU. Koordynuję studencką sekcję Computer-Aided Drug Design, łącząc ML, MM, grafowe sieci neuronowe i metadynamikę. Mam kilka krajowych stypendiów za wyniki akademickie i popularyzację STEM. Kładę nacisk na dokumentację, czysty, testowany kod i powtarzalne, wydajne przepływy pracy. Dostarczam wyniki na wysokim poziomie, informując interesariuszy na każdym etapie.
Umiejętności i kwalifikacje
Programowanie
Usługi
Portfolio
-
732 PLN Symulator dynamiki molekularnej (LJ) w C++
Aplikacje desktopowe
Akademicki projekt C++17: symulacja dynamiki molekularnej 2D z potencjałem Lennarda-Jonesa, obliczeniami all-pairs i zapisem danych do analizy. Wzorce Factory/Builder, wizualizacja Pygame; planowany rozwój do modelu 3D wody z solutami.
-
732 PLN Zautomatyzowany pipeline RNA-Seq w Nextflow
Aplikacje desktopowe
Konteneryzowany, skalowalny workflow RNA-Seq w Nextflow: QC (FastQC/MultiQC), alignacja (STAR/HISAT2), kwantyfikacja (Salmon/featureCounts), analiza różnicowej ekspresji (DESeq2), obsługa Docker/Singularity, CI/CD GitHub Actions.
-
2928 PLN Rozwiązywanie problemów związanych z montażem DNA
Aplikacje desktopowe
Projekt jest zaawansowaną aplikacją przeznaczoną do składania sekwencji DNA przy użyciu metaheurystyki, w szczególności algorytmów genetycznych. Został zaimplementowany w języku C++17 i kładzie nacisk na optymalizację kombinatoryczną.
-
1464 PLN Statystyczna analiza danych medycznych
Aplikacje desktopowe
Modułowa platforma R do analizy danych medycznych z automatycznym testowaniem statystycznym, wizualizacją i raportami HTML.
Aktywność
| Ostatnie oferty 1 | Budżet | Dodana | Terminy | Oferta | |
|---|---|---|---|---|---|
|
Oprogramowanie/aplikacja AI
5000 PLN
|
