Оптимизация БД Opencart2 и медленных запросов

Здравствуйте! Нужно
Оптимизировать работу БД и медленные запросы

Из-за перегруза БД сильно скачет нагрузка на ЦП сервера из-за чего падает скорость работы ресурса.

OpenCart2 / ISPManager / VPS

При возникновении данного явления - мы перезагружаем сервер. После этого какое-то время (до 24 часов) все работает нормально а потом сново понемногу наростает нагрузка и все заново.

ДЕТАЛЬНАЯ ИНФО ПО ПРОЭКТУ И ПРИЧИНЕ ПРОЭКТА

На выходных все норм, а будние дни с раннего утра 4:00/4:30 начинаются сильные скачки нагрузки на процессор сервера, при том даже когда посетителей на сайте очень мало.

Парсеры и всякие загрузчики работают каждый день и только ночью. Но пробовал их удалять - не помогает. поэтому их влияние пока исключается.

Нужно найти источник этих бед)
Нагрузки на ЦП не более 50%, но уже даже при этой нагрузки сайт сильно лагает. Только при работе на 20-30% ЦП сайт работает нормально. Вот пример скрина сегодняшнего
http://prntscr.com/srtjva

Так же наблюдается большая нагрузка на БД в период таких тупняков.
http://prntscr.com/srtoq3
Как говорит один с разработчиков - "причина в Говно коде сайта, надо перебирать в чем именно"По всем анализам и наблюдениям тупняки начинаются вместе с перегрузом БД - соответственно и решение возможно именно в нем.

Некоторые уточнения по ситуации:

- на каком движке сайт?

OpenCart 2

- на сервере есть еще другие сайты кроме того сайта с которым наблюдаются проблемы?

Да. это аналогичный простой магазин на OpenCart 1,5.  

На нем трафика примерно 0. Им не занимаемся. На нем отключены все парсеры и загрузчики.

Но на нем обновляются цены синхронизируясь с первым основным магазином, синхронизация происходит 1 раз в сутки, в 00_00 в течении 2-5 минут. В остальное время синхронизация заблокирована.

- какая посещаемость сайта в день?

в спокойные времена около 200-300/сутки

последний месяц 500-600/день

- какая пиковая посещаемость наблюдалась ранее?

Ранее были пики 1000-1200/день

- каким образом фиксируются скачки нагрузки?

Начинает тупить сайт, и это отслеживаем по графику в системе

http://prntscr.com/snvsuo

http://prntscr.com/snvtb5

- у какого хостинг провайдера находится сайт/сервер?

Ukraine

- какой тип хостинга - виртуальный хостинг, виртуальный сервер, выделенный сервер?

VPS

- какие параметры сервера/тарифного плана?

Операционная система: CentOS 7

Тарифный план: SSD VPS 6G

Память RAM: 6144 Мб

Диск SSD: 70000 Мб

CPU: 2x2.8 Ghz

- каким образом организована техническая поддержка и обслуживание сервера?

Фрилансеры по мере необходимости поддерживают.

как видно по графику, постепенно но линейно растет расход оперативной памяти, и когда нагрузка на ЦП достигает более 60% то это ощущается физически по скорости работы сайта.

Мы перезагружаем сервер - оперативка - падает,  загрузка ЦП так же падает но не так сильно как хотелось бы.

Не давно провели такие работы:

Перешли с CGI на FastCGI

Сделали оптимизацию Nginx + PHP + Mysql

Перешли на PHP7 с PHP5

После этого сайт стал работать заметно быстрее, но периодически остались эти тупняки.

То есть до проделанной работы сайт тупил, местами так же как сейчас местами реже, но в целом это не замечалось так как сейчас т.к. сейчас по умолчанию сайт работает шустро.

а что на счет парсеров? 

-Есть только парсеры xml файлов которые закачивают НАМ товары и обновляют цены и остатки у НАС.

График этих загрузок проставлен на ночь, и обновление 1 раз в сутки, а ночью как видно по графикам нагрузка минимальная.

есть ли скрипты обмена данными с внешними системами (например 1С или CRM какой-то)?

-Нет.

есть ли скрипты создания резервных копий по расписанию?

-Да, резервная копия создается.

http://prntscr.com/snwe8u

Время завершения создания резервных копий припадает на НАЧАЛО нагрузки на ЦП.

И они создаются не каждый день, как видно по скрину. А Проблемы - каждый день.

Есть так же выгрузки типа Гугл Фид, Розетка, Хотлайн.

Но там обновления делаются точечно с обновлением только цен и наличия, большие массивы данных не грузятся.

Переход с isp менеджера не предлагать.

По любой другой информации запрашивайте - предоставлю!

Задача: Оптимизивароть БД и медленные запросы ресурса что бы избежать негативных явления на сервере которые есть сейчас в виде скачков нагрузки на ЦП и постоянного роста расхода оперативной памяти.