Budget: 100 UAH Deadline: 1 day
В вашем случае даже по скудному описанию проблемы на вскидку:
1) в обработке - тяжелые алгоритмы загрузки позиции в то время, когда можно быстро подготовить данные, а далее просто набить документ установки цены и записать. Так же возможны не оптимально подобранные структуры данных для хранения промежуточных данных, из-за которых замедляется поиск требуемых значений.
2) в модифицированной конфигурации - возможно у вас используются механизмы аналогов или связи между прайсами, но вспомогательные объекты не имеют индексов и запросы по ним очень медленные.
3) у вас медленный источник входящих данных - сайт производителя, файлы на FTP или вообще СЭД, но в загрузке 1С этот факт вообще игнорируется и данные загружаются попозиционно, а не втягиваются все скопом.
Точную проблему и путь её устранения (если он возможен) может показать только аудит работы обработки. Если другие вам не помогут, то могу посвятить вашей проблеме выходные.