Jestem studentem 4. semestru Inżynierii Bioinformatycznej na Politechnice Poznańskiej. Prowadzę odtwarzalne badania dynamiki molekularnej (MD) w GROMACS (TIP4P, NVT/NPT) na klastrach HPC i prezentowałem wyniki prof. J. Błażewiczowi. Piszę produkcyjny kod w C++17 (ponad 3 lata, algorytm genetyczny do składania DNA z adaptacyjnym krzyżowaniem/mutacją, Google Test, CMake) i Pythonie (NumPy, SciPy, pandas, MDAnalysis) oraz R/Bioconductor (analizy różnicowej ekspresji, 3D-QSAR). Automatyzuję workflowy od PackMol po analizy trajektorii (RDF, MSD, powierzchnie energii), pracując na Linuxie, Slurmie i…
